Za zdmi biskupské rezidence jej nutila komunistická státní moc strávit období od 19. července 1950 do 16. ledna 1953. Rozsudek ve vykonstruovaném procesu za „velezradu a spiknutí“, kterým biskupa komunistické soudy poslaly do vězení na 25 let, byl zrušen v roce 1968. Česká justice se však dosud nezabývala předcházející nezákonnou internací. Změnit se to rozhodl Jan Kratochvil, ředitel Muzea českého a slovenského exilu a emigrace 20. století, a advokát Lubomír Müller, kteří s tímto podnětem přišli. „Štěpán Trochta byl letitým osobním přítelem naší rodiny. Můj otec byl náčelník Junáka a…